Η διοίκηση της ΕΔΟΠΑ ασκείτε από τον επικεφαλή ο οποίος ορίζεται από το Διοικητικό Συμβούλιο της ΛΕΚ , σύμφωνα με κριτήρια που θεσπίζει το Δ.Σ. και ορίζονται στον Εσωτερικό κανονισμό  11Β -1 2012 ΙΙΙ "Περί λειτουργίας  ΕΔΟΠΑ" .

Η ΕΔΟΠΑ ανάλογα με το αντικείμενο της χωρίζετε σε Ομάδες οι οποίες διοικούνται από Ομαδάρχες που ορίζονται από τον Επικεφαλή.